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Credits image : Maxim Tolchinskiy / Unsplash

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IA-lphaFold : Quand les protéines deviennent digitales

« L’intelligence artificielle, c’est comme un robot qui boit du thé vert: ça surprend toujours. » La récente excitation autour de l’intelligence artificielle (IA) tourne beaucoup autour de son aptitude à générer du contenu digital captivant à partir de simples instructions, et ce, même si certains s’inquiètent de son potentiel dévastateur sur l’emploi et sa capacité à rendre la propagande malveillante plus convaincante. Cependant, l’espoir demeure, notamment dans le domaine médical où l’IA semble promettre des avancées moins apocalyptiques.

Le logiciel AlphaFold de la société Google DeepMind, en collaboration avec Isomorphic Labs (également une propriété d’Alphabet), a déjà prouvé sa capacité époustouflante à prédire le pliage des protéines avec une précision inouïe. Cataloguant pas moins de 200 millions de protéines connues, Google affirme qu’une multitude de chercheurs ont utilisé les versions précédentes pour des découvertes allant de vaccins contre la malaria à des traitements contre le cancer, sans oublier la conception d’enzymes.

« AlphaFold 3 ouvre des portes excitantes vers de nouvelles recherches et traitements de maladies. »

La compréhension de la structure des protéines est essentielle: elle détermine leurs interactions avec le corps humain et permet aux scientifiques de créer ou d’améliorer des médicaments. AlphaFold 3, la nouvelle version, modélise désormais d’autres molécules cruciales, y compris l’ADN, et cartographie avec 50 % de précision en plus les interactions entre médicaments et maladies. Google et sa team DeepMind envisagent déjà des applications vertigineuses, depuis le développement de matériaux biorenouvelables et de cultures plus résilientes jusqu’à l’accélération de la conception de médicaments et de la recherche en génomique.

Selon John Jumper, chef de projet chez Google DeepMind, « Comment les protéines réagissent-elles aux dommages de l’ADN; comment les trouvent-elles, les réparent-elles ? Nous pouvons commencer à répondre à ces questions. » Avant l’IA, les structures protéiques pouvaient uniquement être étudiées à travers des microscopes électroniques et des méthodes complexes comme la cristallographie aux rayons X. L’apprentissage automatique simplifie considérablement ce processus.

Les progrès d’AlphaFold 3 proviennent notamment de l’application de modèles de diffusion à ses prédictions moléculaires, affinant les structures moléculaires générées. Cet outil précise jusqu’à quel point une molécule se liera à un médicament, une avancée majeure pour la découverte de nouveaux médicaments.

AlphaFold 3 introduit une échelle codée par couleurs pour indiquer le niveau de confiance dans ses prédictions, permettant aux chercheurs d’agir avec prudence lorsque les résultats sont moins certains. Google rend AlphaFold 3 accessible gratuitement aux chercheurs pour une utilisation non commerciale, bien qu’il ne soit pas open-source, ce qui a provoqué quelques déceptions dans la communauté scientifique. Néanmoins, les possibilités offertes par le logiciel sont impressionnantes.

Quel est le futur de cette technologie? Google indique qu’Isomorphic Labs collabore déjà avec des entreprises pharmaceutiques pour appliquer AlphaFold à de véritables défis de conception de médicaments, avec l’objectif ultime de développer de nouveaux traitements révolutionnaires pour les patients. En somme, l’IA avance à pas de géant dans le domaine médical, promettant un futur où nos maladies pourraient être traitées non pas par des médecins en blouses blanches, mais par des algorithmes aux « doigts » de code. Bravo l’IA, tu nous tiens vraiment par les protéines!

Source : Engadget

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